En el año 1.950 la escuela rural de la Ceja de guayabal empezó a funcionar  en el paraje de la Ceja, en una casa antigua  familiar de tapia  y teja de barro  del señor Antonio Gómez, con su primera docente, Emperatriz  Muñoz,  quien atendió los grados 1º Y 2º, asistiendo alternadamente día por día así: Lunes, Miércoles y Viernes  los niños; Martes y Jueves las niñas y en la siguiente semana se rotaba, primero las niñas y luego los niños. El Horario era de 8:00 am a 12:00 pm y de 2:00 pm a 4:00 pm de lunes a viernes, y sábado de 8: 00 a 12: 00 pm. Luego paso a funcionar en la casa del señor Gilberto García.

El 28 de noviembre de 1.959 por ordenanza 21, fue creada con el nombre de escuela rural alternancia la Ceja guayabal.

En febrero de 1.971 se denomina Escuela Rural Integrada Los Pomos de Guayabal, según la escritura 123 del 27 de abril de 1.975 el municipio de Sopetrán compró el terreno al señor Eduardo Torres y se construyó la escuela en cuatro meses, con el apoyo de la Federación Nacional de Cafeteros y comunidad.

En 1.980 Se construyó el primer acueducto veredal para el beneficio de cuarenta familias y la escuela

El 9 de marzo de 1983, según escritura 143 el municipio de Sopetrán representado por el señor alcalde Isaac Marín Montoya, compra el terreno para la construcción del campo deportivo.

A raíz de la resolución 0308854 de marzo 21 de 2014, mediante la cual se da una reorganización educativa, la escuela es anexada como sede de la institución Educativa José María Villa, recibiendo así el nombre que lleva en la actualidad “Institución Educativa José María Villa sede Los Pomos.